Čepro při tak obrovské kapacitě skladovaných paliv dlouho umožňovalo mlhavý způsob často fiktivních a několikanásobných předprodejů. Objem daňových podvodů při těchto operacích v Čepru proto experti odhadovali na pět miliard ročně. Pod vedením generálního ředitele Jiřího Borovce, který je ve funkci od ledna 2008, Čepro formální předprodeje ve svých skladech zakázalo.
