Baterie o 28 modulech byly stále nikl-metal hydridové (NiMH), oproti předchůdci se ale výrazně zmenšily a zlehčily. A to přesto, že jejich vyšší kapacita umožnila již zmíněné výrazné zvýšení výkonu vozu. Podle japonského cyklu Prius v průměru spotřeboval 2,8 l/100 km, americká norma tuto hodnotu upravila na 5,1 l/100 km.
