Podnět k aktivaci ve prospěch civilního obyvatelstva dává hlavní hygienik prostřednictvím Ředitelství pro operace ministerstva obrany. Do dvou hodin od přijetí žádosti je zahájena aktivace systému pro zajištění karantény, izolace a léčby pacientů s vysoce nakažlivou nemocí či s podezřením na ni.
